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Certaines enzymes de restriction reconnaissent un segment d’ADN qui a la même séquence qu’elle soit lue dans le sens 5′–3 ’sur un brin ou dans le sens 5′–3’ sur le brin complémentaire. Un exemple est illustré sur la figure. Quel terme est donné à ce modèle?
Cette question nous interroge sur les enzymes de restriction. Passons en revue ce que sont les enzymes de restriction et comment elles peuvent être utilisées pour manipuler l’ADN.
Les enzymes de restriction sont des outils utiles en biotechnologie car elles peuvent cliver des séquences d’ADN spécifiques afin de les combiner de manière intéressante. Elles ont été initialement découvertes dans les bactéries comme un moyen pour celles-ci de se défendre contre une infection virale. Les enzymes de restriction peuvent cliver l’ADN viral en morceaux, afin d’empêcher le virus de poursuivre son cycle de vie.
Il existe de nombreuses enzymes de restriction différentes, et chacune a sa propre séquence d’ADN cible qu’elle reconnaît et clive. Il s’agit d’un site de reconnaissance ou de restriction. Ces séquences de reconnaissance sont des palindromes, ce qui signifie qu'elles sont lues de la même façon dans un sens ou dans l’autre. Le mot radar est un exemple de palindrome parce qu’il s’écrit «radar», que nous le lisions dans un sens ou dans l’autre.
La figure fournie est le site de reconnaissance d’une enzyme de restriction, qui est un palindrome. Si on lit la séquence dans le sens cinq prime à trois prime sur le brin supérieur, nous voyons que c’est GAATTC. Et si nous regardons le brin opposé et le lisons à l’envers, nous obtenons toujours GAATTC. Ainsi, on parle de palindrome dans l’ADN lorsque la séquence du brin cinq prime à trois prime est la même que la séquence du brin complémentaire lue dans le sens cinq prime à trois prime. Donc, le motif illustré dans notre question représente un palindrome.
